يهدف البرنامج الوطني الى الإسهام في رفع كفاءة وجودة تنفيذ مشاريع الجهات العامة وإدارة المرافق العامة، عبر تطوير منهجية علمية وعملية لإدارة المشاريع والمرافق، تساعد هذه الجهات على تطبيق أفضل الممارسات العالمية وضبط أدائها، وتحقيق تحوّل شاملٍ في مجال إدارة المشاريع والمرافق في الجهات الحكومية، ونقلهِ من كونه مجالاً ينطلق من المعرفة عن طريق التجربة الفردية إلى إيجاد معرفة مؤسسية مبنية على الخبرات الوطنية والعالمية، إذ قام برنامج مشروعات بترجمة هذه الخبرات إلى أدلة ونماذج وإجراءات تمثل مرجعاً لحوكمة المشاريع الحكومية بالمملكة العربية السعودية. ولتعظيم الاستفادة من منهجية مشروعات، يعمل البرنامج على تمكين الجهات الحكومية وإعادة هيكلة إداراتها المعنية بالمشاريع والمرافق، لتمكينها من تطبيق المنهجية والوفاء بمتطلباتها، وإيجاد معايير توجّه القرارات الخاصة بإدارة المشاريع والمرافق فيها، و بناء القدرات البشرية العاملة في إدارة المشاريع والمرافق، بالاستناد إلى التجارب الوطنية الثرية وأفضل ما توصلت إليه الخبرات العالمية من ممارسات في هذا المجال.